Η κατάσταση όταν μια συνεχή οικοτόπων έχει γίνει διαιρούνται σε ξεχωριστές, συχνά απομονωμένες μικρών ενημερωμένων εκδόσεων κώδικα διασκορπισμένες με άλλους οικοτόπους. Μικρά τμήματα των οικοτόπων μπορεί να υποστηρίξει μόνο μικρές πληθυσμούς της πανίδας και αυτές είναι πιο ευάλωτος σε εξαφάνιση. Οι ενημερωμένες εκδόσεις κώδικα ενδέχεται να μην είναι ακόμη η ενδιαιτήσεως από είδη που καταλαμβάνουν την αρχική αδιαίρετης οικοτόπων. Ο κατακερματισμός επίσης συχνά παρακωλύει ειδών από «μετακινήσετε» μεταξύ των πληθυσμών.

Κατακερματισμού των οικοτόπων προέρχεται από γεωλογικές διεργασίες που σιγά-σιγά να μεταβάλλει τη διάταξη του φυσικού περιβάλλοντος ή ανθρώπινες δραστηριότητες όπως η γη συμψηφισμού, στέγαση, της αστικής ανάπτυξης και κατασκευή οδών ή άλλων έργων υποδομής. Αρνητικές επιπτώσεις μερικές φορές δεν είναι άμεσα αισθητές και φαινομενικά μπορεί να διατηρείται επαρκής οικοτόπων. Ωστόσο ενδογαμία, η έλλειψη των εδαφών και την έλλειψη τροφίμων είναι ορισμένα από τα προβλήματα που μπορεί να παρουσιαστούν με μικρούς πληθυσμούς. Κατακερματισμού των οικοτόπων, επομένως, αναμένεται να οδηγήσει σε απώλειες της ποικιλότητας των ειδών μακροπρόθεσμα.