Η ικανότητα του ένα φυτό να αντέχει το φυτοφάρμακο. Ζιζανιοκτόνο αντίσταση υπήρξε ένας από την πρώιμη στόχους των φυτικών γενετικής μηχανικής. Εάν ένα ζιζανιοκτόνο είναι ψεκάζονται σε ένα πεδίο έχουν φυτευθεί με τέτοια ανθεκτικά φυτά, τότε όλα τα φυτά εκτός από την καλλιέργεια θα θανατωθούν, παρέχοντας έτσι μια αποτελεσματική μέθοδος βοτάνισμα χωρίς να χρειάζεται να αναπτυχθεί ειδικά για κάθε τύπο weed ζιζανιοκτόνα. Εκεί είναι σημαντική ανησυχία σε ορισμένες πλευρές σχετικά με την ευρεία χρήση της τεχνολογίας αυτής, η οποία ουσιαστικά δίνει τη δυνατότητα να παρακάμψουν πιο αποτελεσματική ζιζανιοκτόνα του ανθρώπου το φυτικό Βασίλειο. Η ανησυχία είναι ότι, πρώτον, τέτοια τεχνολογία θα οδηγήσει σε αύξηση της χρήσης των ζιζανιοκτόνων του, σε μια στιγμή που όταν είναι γενικά αποδεκτό ότι η χρήση χημικών ουσιών θα πρέπει να διατηρούνται όσο το δυνατόν, και ότι, δεύτερον, υπάρχει η πιθανότητα ότι θα ξεφύγει από ανθεκτικά στα καλλιεργούμενα φυτά να γίνει ζιζανίων, ή ότι τους γονίδια θα μπορούσαν να μεταφερθούν σε άλλα είδη, συμπεριλαμβανομένων των ζιζανίων.