Επίσης γνωστό ως η μετάλλαξη ή να αυτο-κρυπτογραφήσουν ιούς, έναν ιό που μπορεί να αλλάξει το σχέδιο ψηφιολέξεων, όταν αυτό αναπαράγει, την αποφυγή ανίχνευσης από απλές τεχνικές ανίχνευσης συμβολοσειρά. Κάποια χρήση Πολυμορφικών ιών διαφορετική κρυπτογράφηση συστημάτων και απαιτούν διαφορετικές αποκρυπτογράφηση ρουτίνες. Έτσι, το ίδιο ιό μπορεί να φαίνεται εντελώς διαφορετική σε κάθε σύστημα ή ακόμη και μέσα σε ξεχωριστά αρχεία. Άλλων πολυμορφικών ιών ποικίλλουν αλληλουχίες διδασκαλίας και χρησιμοποιούν ψευδή εντολές σε μια προσπάθεια να ματαιώσει λογισμικό κατά των ιών. Ένα από τα πιο προηγμένων Πολυμορφικών ιών χρησιμοποιεί μια μετάλλαξη κινητήρα και γεννήτριες τυχαίος-αριθμού για να αλλάξετε τον κωδικό του ιού και την ρουτίνα αποκρυπτογράφησης.