Μια μέθοδος για τη μέτρηση του ποσού της ένα συγκεκριμένο mRNA και το μήκος σε σχέση με μια γνωστή ακολουθία. Α επισημαίνονται συνθετικό αστάρι σχεδιασμένο για τη συμπληρωματικότητά της με μια ακολουθία σε το mRNA, συνήθως κοντά στο 3'-τέλος, είναι αντίστροφη μεταγραφή για τη δημιουργία ενός cDNA που από την ένταση της το μαρκάρισμά του υποδεικνύει την ποσότητα του mRNA αρχικά παρούσες, και από την κινητικότητα σε πήκτωμα ηλεκτροφόρησης υποδεικνύει το μήκος, και ως εκ τούτου το μήκος του mRNA από την τοποθεσία της κατάσχεσης αστάρι για 5'-τέλος.